PROYECTO QUIMICA ORT DEL GENOMA HUMANO

Investigación en bioquímica molecular y proteómica 2008
Por cuarto año consecutivo los alumnos del último año de la especialidad Química de la Escuela Técnica ORT Argentina realizarán sus proyectos finales en distintas universidades y centros de investigación con profesionales reconocidos. La metodología de trabajo evita la transpocisión didáctica permitiendo a los estudiantes realizar su actividad final en los lugares donde se está generando el conocimiento.
La articulación entre el nivel medio y el postgrado universitario es auspiciada por el CONICET (Consejo Nacional de Investigación Científica y Técnica).
Los proyectos de investigación para el año en curso son:

1) Evaluación de la expresión de la molecula de adhesión cadherina epitelial en tejidos humanos normales y tumorales.
Investigador: Dra. Mónica Vazquez-Levin.
Instituto: Instituto de Biología y Medicina Experimental(IBYME - CONICET).
Alumnos: Yael Dobzewicz Y Gala Szapiro.

Blog: http://www.proyecto-6q.blogspot.com/

2) Acción del hexaclorobenceno (HCB) sobre la uroporfirinogeno de una línea celular hepatocitos humanos. Mecanismo de acción.
Investigador: Dra. María del Carmen Ríos de Molina.
Instituto: Departamento de Química Biológica, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales.
Alumnos: Lucas Toiw y Uriel Frid.

Blog: http://www.proyectofrid-toiw08.blogspot.com/

3) Modelos experimentales de enfermedades metabólicas: Porfiria y Síndrome Metabólico. Proteómica y Metabolómica de estos disturbios.
Investigador: Dra. Marta Blanca Mazzetti.
Instituto: Departamento de Química Biológica, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (UBA).
Alumnos: Maria Duperron y Mauro Elencwajg.

Blog: http://www.proyectofinal6q.blogspot.com/

4) Factores no hemodinámicos relacionados con la génesis y evolución de la proteinuria durante la enfermedad renal progresiva.
Investigador: Dra. Elsa Zotta.
Instituto: Laboratorio de Fisiopatogénia, Departamento de fisiología, Facultad de medicina, UBA.
Alumnos: Barbara Helueni y Melanie Naiman.

Blog: http://www.proyectoq08.blogspot.com/

5) Estudio de la participacion de la anandamida en la regulacion de la interaccion espermatozoide-ovioducto en un modelo bovino.
Investigador: Dra. Silvina Perez Martinez.
Instituto: Facultad de medicina - UBA.
Alumnos: Judith Arenas Tenenbaum y Melina Braverman.

Blog: http://www.scienceproject08.blogspot.com/

6) El estudio de los mecanismos moleculares involucrados en la regulación del gen UGA4 de Saccharomyces cervisiae en respuesta a cambios en la disponibilidad de nutrientes con el fin de dilucidar las distintas cascadas de señales desencadenadas por dichos nutrientes y establecer sus interconexiones.
Investigador: Dra Susana Correa García.
Instituto: Departamento de Química Biologica, Facultad de ciencias Exactas y Naturales, UBA.
Alumnos: Iván Mikiej y Victoria Salama

Blog: http://www.proyectoquimica22.blogspot.com/

7) Diagnóstico de la enfermedad de Von Willebrand (VWD) tipo 2N por técnicas fenotípicas y genotípicas.
Investigador: Dra. Adriana I. Woods.
Instituto: Instituto de Investigaciones Hematológicas "Mariano R. Castex" de la Academia Nacional de Medicina.
Alumnos: Abigail Skverer y Daniela Lin

Blog: http://www.vwd-diagnostico.blogspot.com/

8) Estudio de la mielinogenesis en el sistema nervioso periferico en condiciones fisiologicas y patologicas. Participacion de celulas pluripotentes en el proceso de degeneracion-regeneracion nerviosa.
Investigador: Dra Patricia Setton-Avruj.
Instituto: Departamento de Quimica Biologica, Facultad de Farmacia y Bioquimica (IQUIFIB-UBA-CONICET).
Alumnos: Averbuj Daniel y Eitan Rozenszajn.

Blog: http://www.proyectoaverbuj-rozenszajn.blogspot.com/

9) Diseño y desarrollo de vacunas antitumorales empleando bacterias y celulas tumorales modificadas con genes inmunomodiladores. Estudio de los mecanismos inmunes inducidos.
Investigador: Claudia I. Waldner y Claudia Mongini.
Instituto: Laboratorio de inmunologia celular y molecular. Centro de Estudios Farmacologicos y Botanicos (CEFYBO. CONICET-UBA)
Alumnos: Amalia Surijon y Maria Belen Tolava Rivero.

Blog: http://www.amibeluproyecto.blogspot.com/

10) Marcadores Geneticos Asociados al Cáncer.
Investigador: Dr.Javier Hernán Cotignola.
Instituto: Laboratorio de Cáncer y Apoptosis del Departamento de Quimica Biologica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales de la UBA.
Alumnos: Ayelén Marano y Solange Perchik

Blog: http://www.marcadoresgeneticos.blogspot.com/

11) Expresion del canal de la conductancia transmembranal de la Fibrosis Quistica (CFTR) en placentas Preeclampticas: posible rol en la regulacion de la actividad de la Acuoporina-9 (AQP9).
Investigador: Dr Alicia E Damiano.
Instituto: Catedra de Biologia Celular, Departamento de Ciencias Biologicas, Facultad de Farmacia y Bioquimica (UBA)
Alumnos: Gabriel Colodenco y Martín Sapir.

Blog: http://proyectofinalcs.blogspot.com/

12) Proteómica de factores secretados por células de cáncer de mama y mama normal con capacidad inhibitoria de la producción lipídica.
Investigador: Dra.Guerra de Grignoli Liliana Noemi.
Instituto: Departamento de Ciencias biologicas. Facultad de ciencias exactas y naturales, UBA-CONICET.
Alumnos: Fabiana Durante y Tamara Broitman.

Blog: http://tyf-proyecto08.blogspot.com/

13) Estudio de la Growth Associated Protein (GAP-43), su interacción con la Ubicutina y su participación en el control del ciclo celular en células NIH3T3 transfectadas en forma estable y transiente. Efecto de la Apo-transferrina en la remielización: participación de la vía Notch en la diferenciación oligodendrioglial.
Investigador: Dra Ana M. Adamo
Instituto: Departamento de Química Biológica Patológica, Facultad de Farmacia y Bioquímica de la UBA. CONICET.
Alumnos: Rodrigo C. Pampin y Robby Mattes

Blog: http://gap-43.blogspot.com/

14) Interacción de sumo-1 y mage-a2 en la regulacion del oncosupresor p53
Investigador: Martín Monte
Instituto: Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (UBA)
Alumnos: Leonel Stermann y Yair Litman

Blog: http://proyectosumo.blogspot.com/

15) Neovascularización en un modelo murino de inflamaciòn aguda inducida por LPS.
Investigador: Eulalia de la Torre.
Instituto: Facultad de Medicina - Uba - Laboratorio de Inmunofarmacologia
Alumnos: Federico Mauas Walach, Pablo Kuleff.

Blog: http://finalproyectort.blogspot.com/

lunes, 18 de agosto de 2008

sábado, 26 de julio de 2008

Semana 9

Caracterización de las proteínas

La semana pasada separamos unas proteínas
Hoy lo que vamos a hacer va a ser correr por electroforesis esas proteínas

Luego realizaremos un Western Blot, este nos dirá si posee las proteínas que estamos buscando.

Pero... ¿Que buscamos?
Buscamos enzimas específicas que afectan directa o indirectamente la producción de lípidos, lo que intentamos encontrar en es que momento de la producción lipídica del adipocito esta afectando nuestro factor.

Técnica utilizada:

El western blot es un método en biología molecular/bioquímica/inmunogenética para la detección de proteínas en una muestra de un tejido homogeneizado o extracto. Implementa gel electroforesis para separar proteínas desnaturalizadas de la masa. Las proteínas son transferidas desde el gel hacia la membrana (originalmente de nitrocelulosa), donde son examinadas utilizando anticuerpos específicos para la proteína. Como resultado, los investigadores pueden examinar la cantidad de proteínas en una muestra y comparar los niveles de presencia entre varios grupos.

viernes, 11 de julio de 2008

Semana 8

10/7

Hoy preparamos los elementos para fabricar una curva, y determinar asi la cantidad de proteinas, y ver si estas se ven afectadas por el factor.

debido a que el procedimiento es muy largo nosotras solo alcanzamos a preparar los elementos pero no a fabricar la curva, la proxima vez que vengamos nos diran los resultados.

Entonces...
volvemos a tomar muestras de:
Factor
Diferenciadas
Control

Lo que hay que hacer es centrifugar en frio.
como hay que poner muy poca cantidad en los tubitos de centrifuga, lo que hicimos fue filtrar.



Luego lo que hicimos fue ponerlo en la centrifuga y como esto se hace en frio lo metimos en la heladera.




Luego lo que hicimos fue armar el gel para la electroforesis
Utilizamos 15%


Este luego lo utilizaremos para correr las proteinas que resulten de esta experiencia

viernes, 4 de julio de 2008

Semana 7

03/07
Cromatografía en columna de Tamiz molecular o de exclusión molecular:
A diferencia de lo que ocurre en otras cromatografías, en el caso ideal de la cromatografía de exclusión molecular no existen interacciones por atracción entre la "fase estacionaria" y el soluto. Mas bien la fase móvil liquida o gaseosa pasa a través de un gel poroso. Los poros son lo suficientemente pequeños para excluir las moléculas grandes de soluto, pero no las pequeñas. La corriente de moléculas grandes pasa sin penetrar en el gel .las moléculas pequeñas requieren mas tiempo para pasar a través de la columna porque entran en el gel y por lo tanto deben fluir por un volumen mas grande antes de dejar la columna.

Hoy realizamos esta columna para separar y purificar nuestra proteína de interés.
1) filtramos el medio

2) Columna

jueves, 26 de junio de 2008

Semana 6

26/06
HOY NOS DEDICAMOS A AYUDAR A NUESTRA INVESTIGADORA CON LA RUTINA DIARIA.
LO QUE HICIMOS FUE FABRICAR MEDIO CONDICIONADO EN GRANDES CANTIDADES PARA TENER STOCK.
Y LUEGO LO FRACCIONAMOS A DISTINTAS CONCENTRACIONES.

jueves, 19 de junio de 2008

Semana 5

Día 19/6

La semana anterior Debido a una falla en las estufas se murieron nuestras células.

Fabricamos una curva de tiempo para ver el crecimiento de los lípidos

C=control--> pre-adipocitos
D=diferenciados--> adipocitos maduros
F=factor--> adipocitos maduros + proteína TgIF

Cada uno de estos se cultivo y se fueron levantando y congelando a diferentes tiempos. Luego se les agregamos un reactivo que toma color en presencia de lípidos, y medimos con espectrofotometría


Resultado obtenido:





SE PUEDE COMPROBAR COMO LUEGO DE AGREGADA LA PROTEINA INHIBIDORA LA CANTIDAD DE LIPIDOS DISMINUYE, ESTO NOS MUESTRA QUE NUESTRO FACTOR FUNCIONA, ESTA PRUEBA SE REALIZO 3 VECES Y SE VIO QUE EL CAMBIO ES MUY SIGNIFICATIVO, LOS RESULTADOS SIEMPRE FUERON PARECIDOS

jueves, 5 de junio de 2008

Semana 4

Día 5/08

1. Revisamos la evolución de nuestras células.

2.Como no hubo mucho crecimiento solo les renovamos el medio.

Hasta hoy solo habiamos trabajado con células adiposas, hoy empezamos con las células epiteliales de mama, de estas a nosotras nos interesa una proteina que produce que inhibe la produccion de lipidos de los adipocitos, para aislarla del medio hay que seguir una serie de pasos:

1.Para empezar vamos a concentrar el medio donde estan nuestras células(sacarle el agua):
* Vamos a poner el medio en una membrana de dialisis-->"camita" de polietilenglicol



2.Tenemos que preparar un buffer para pasar nuestro medio por una columna de afinidad (para separar las proteinas)
Preparación de buffer C:
Se preparan 2 soluciones
*0.2M Na2HPO4
*0.2M NaHPO4
Luego ponemos 36ml de la primera y 14ml de la segunda]-->50ml de agua
así obtenemos un buffer 0.2M pH=7
Después hacemos una dilucion 1/10 para obtener el buffer 0.02M

Ya la proxima haremos la columna.
Hasta la semana que viene.
Fabiana y Tamara